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授課內容Content

Week 1： Course introduction and MATLAB environment
課程簡介與MATLAB程式環境介紹
內容與目標：說明課程目標、誘發學習動機，第一次動手使用MATLAB
［Handouts］Lesson1_slides.pdf
［Matlab installation guide］說明文件
請下載最新版本，如硬碟空間足夠請安裝完整toolbox
如硬碟空間有限，請至少安裝表列toolbox
［EMI Course video］Please switch to 1080p 
(1) Course introduction (52:25)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 課程介紹 (1:13:02)

Week 2： Basic language usage - medical image import
MATLAB基礎語法－醫學影像存取
內容與目標：認識MATLAB基本語法，實作讀取DICOM醫學影像專用格式
［Handouts］Lesson2_slides.pdf
［Materials］Materials_L2.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) MATLAB Basic Language (56:18)
(2) DICOM Image Import (20:21)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 基礎語法 (1:01:00)
(2) DICOM醫學影像讀取 (34:43)

Week 3： Matrix operation and computation - image size and resolution adjustment
矩陣取值、運算－影像局部處理與解析度調整
內容與目標：影像處理第一步－學會醫學影像局部取值與運算
［Handouts］Lesson3_slides.pdf
［Materials］Materials_L3.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) MATLAB Matrix Operation (58:17)
(2) Local Image Process & Resolution Adjustment (27:37)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 矩陣取值與運算 (1:07:02)
(2) 影像局部處理與解析度調整 (23:50)

Week 4： Function - image smoothing and edge detection
函式建立與應用－影像平滑化與邊緣偵測
內容與目標：透過運用函式與矩陣運算概念，學會影像降噪與邊緣偵測
［Handouts］Lesson4_slides.pdf
［Materials］Materials_L4.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) MATLAB Function (51:10)
(2) Image Smoothing and Edge Detection (35:34)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 函式建立與使用 (49:44)
(2) 影像濾波：平滑化與邊緣偵測 (36:15)

Week 5： Structure array - DICOM metadata and contrast adjustment
結構矩陣－DICOM資訊與影像對比調整
內容與目標：認識結構矩陣，學會使用DICOM資訊與調整影像對比
［Handouts］Lesson5_slides.pdf
［Materials］Materials_L5.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) MATLAB structure array (1:04:49)
(2) DICOM information and Contrast adjustment (34:03)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 結構矩陣 (53:54)
(2) DICOM資訊與影像對比 (36:21)

Week 6： Cell array - read and write Excel file
異質矩陣－Excel資料讀寫
內容與目標：認識異質矩陣，習得整理複雜醫學資料的技巧
［Handouts］Lesson6_slides.pdf
［Materials］Materials_L6.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) MATLAB cell array (43:03)
(2) Excel Read/Write (41:12)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 異質矩陣 (53:54)
(2) Excel讀寫 (36:21)

Week 7： Flow control, for-loop and while-loop - import and calculation of 3-dimensional images
流程控制for-loop與while-loop－三維影像存取與運算
內容與目標：透過迴圈控制，事半功倍完成龐大且具重覆性的三維影像處理
［Handouts］Lesson7_slides.pdf
［Materials］Materials_L7.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) MATLAB for-loop (1:13:21)
(2) Import and process of 3D images (24:26)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 迴圈控制 (1:10:49)
(2) 三維影像讀取與運算 (28:53)

Week 8： Flow control, if-else and switch-case - region of interest and thresholding
流程控制if-else與switch-case－影像閾值運算
內容與目標：透過條件判斷，區分不同影像成分
［Handouts］Lesson8_slides.pdf
［Materials］Materials_L8.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) MATLAB if-else (44:28)
(2) Region of interest and thresholding (39:55)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 條件敘述 (1:03:01)
(2) 區域圈選與閾值運算 (36:25)

Week 9： Midterm computer test
期中考－醫學影像處理上機實測
內容與目標：透過實際情境挑戰，確認學生基本程式與影像處理能力
［11301 Materials］Materials_Midterm.zip
［11301 Question sheet］Link
［11301 Score］Link
［11201 Miro board］Link

考古題 Previous midterm exams：
［11201 Materials］Materials_Midterm.zip
［11201 Question sheet］Link
［11101Midterm materials］Materials_Midterm.zip
［11101Question sheet］Question sheet

［11001Midterm materials］Materials_Midterm.zip
［11001Question sheet］Question sheet

［10901Midterm materials］Materials_Midterm.zip
［10901Question sheet］Question sheet

［10801Midterm materials］Materials_Midterm.zip
［10801Question sheet］Question sheet

［10701Midterm materials］Materials_Midterm.zip
［10701Question sheet］Question sheet, English

Week 10： Midterm discussion and orientation of final team project
期中考檢討、3D列印專題分組與期末目標說明
內容與目標：說明下半學期專題目標，使用醫學影像完成第一次3D列印
［Handouts］Lesson10_slides.pdf
［分組登錄］登錄網址
［分組名單］查看網址
［影像資料］請按右鍵另存目標為檔案
1. Brain MRI
2. Dental CT
3. Heart (Cardiac) CT
4. Lower Extremety CT
5. L-spine CT
6. Pelvis CT
7. Rat Skull microCT
8. Skull CT
9. T-spine+Ribs (Chest) CT
10. Upper Extremety CT
11. Whole Body CT

Week 11： Graphic structure - data and image display
圖形架構與資料繪製－資料曲線與影像繪製
內容與目標：學會將數據資料，以曲線或影像繪製方式進行呈現
［Handouts］Lesson11-1_slides.pdf
［Materials］Materials_L11_1.zip
［Handouts］Lesson11-2_slides.pdf
［Materials］Materials_L11_2.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) Graphics structure & data display (1:03:11)
(2) Image display and colormap (37:51)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 圖形架構與曲線繪製 (1:01:31)
(2) 影像色階度調整 (31:52)

Week 12： 3D object rendering - surface and volume rendering
3D立體影像繪製與建模－表面與體積描繪
內容與目標：學會將三維影像繪製成具有光影效果的3D物件
［Handouts］Lesson12_slides.pdf
［Materials］Materials_L12.zip
［EMI Course videos］Please switch to 1080p
(1) Surface Rendering (1:00:19)
(2) Post-processing of 3D Surface (28:23)
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 3D表面繪製 (1:12:11)
(2) 表面後處理 (31:24)

Week 13： Introduction of 3D printing and STL file output
3D列印原理與檔案輸出－產生STL檔
內容與目標：以醫學影像建置之3D物件模型，輸出為3D列印所需之STL格式
［Handouts］Lesson13_slides.pdf
［Materials］Materials_L13.zip
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 產生STL檔 (1:00:59)
(2) 以CURA產生G-CODE檔 (34:51)

Week 14： Operation of 3D printer and G-code file
3D列印機操作說明與列印示範
內容與目標：以實際列印進行說明，了解3D列印操作流程，並認識陽明交大創客空間
［Handouts］Lesson14_slides.pdf
［Course videos］請調整為1080p解析度觀看
(1) 期末專題說明 (28:15)
(2) 3D列印操作注意事項 (49:17)

Week 15： 3D printing hands-on at NYCU Maker Space
創客空間Maker Space－3D列印實作
內容與目標：將經過影像處理與輸出的模型，進行3D列印製作成品

Week 16：Final team competition
內容與目標：分享與討論 影像處理與3F列印的成果、困難與解決方式
［11201 Score］ Link
［11201 Miro board］ Link

［11101 Final presentation］Padlet Link

Week 17： Introduction of graphic user interface I-GUIDE
內容與目標：使用者作介面介紹，讓零散的程式碼整合為圖形介面
［Handouts］Lesson15_slides.pdf
［Materials］Materials_L15.zip

Week 18： Introduction of graphic user interface II-App designer
內容與目標：使用者作介面介紹，讓零散的程式碼整合為圖形介面